J Comput Biol: A New Method To Predict The Target Of Antiviral Drugs Or Vaccines

Eine neue Methode zur Vorhersage der vielversprechendsten antiviralen Medikamente oder Impfstoffziele basiert auf den konformen Veränderungen, die virale Glykoproteine während der Erkennung und Bindung an Wirtszellen erfahren. Diese Vorhersagemethode zielt auf die Hauptketten-Wasserstoffbindung des höchsten freien Energiemotivs ab. Die entsprechenden Forschungsergebnisse werden im Journal of Computational Biology veröffentlicht, einer von Mary Ann Liebert herausgegebenen Fachzeitschrift.

Robert Penner ist Vorsitzender von Rene Thom am Französischen Institut für Hochschulbildung (Bures-sur-Yvette) und der UCLA Mathematical Biology. Er ist der Autor dieses Artikels mit dem Titel "Backbone Free Energy Estimator applied to Viral Glycoproteins"

Bildquelle: Mary Ann Liebert, Inc., Verlag

Da das Virus in die Wirtszelle gelangt und absorbiert wird, erfährt das Virus in der Regel eine kräftige Rekombination und bildet ein Fusions-/Infiltrationsmotiv. Penner schlug eine allgemeine Methode zur Vorhersage hochkonform aktiver Rückstände aus der dreidimensionalen Struktur viraler Glykoproteine vor. Die Methode umfasst die Analyse der Wasserstoffbindungen des Proteins und die Berechnung der freien Energieunterschiede der entsprechenden Merkmale, um die Bereiche zu bestimmen, in denen die Konformationsänderung am wahrscheinlichsten ist. Die in diesem Papier vorgeschlagene Methode wird derzeit für das Spike-Glykoprotein von SARS CoV-2 verwendet, das COVID-19 verursachen kann.

Misha Gromov vom Institute of Advanced Science und der New York University sagte: "Eine mathematische Idee führt direkt zu einer praktischen Bedeutung, die einfach ein Wunder ist, aber die Belohnung ist riesig, weil sie in Maxwells elektromagnetischer Feldtheorie vorkommt - sie bringt Radio und Fernsehen und öffnet die Tür zu theoretischen Berechnungen in unserer digitalen Welt." Er ist ein berühmter Mathematiker und Abel-Preisträger (auch bekannt als Nobelpreis für Mathematik). "Nur wenn sein Autor ein angesehener Mathematiker ist, aber auch einen breiten wissenschaftlichen Horizont hat, ist eine solche Idee möglich, und dies ist selten unter den besten Mathematikern unserer Zeit. Robert Penner ist so ein seltener Mathematiker, er fand heraus, dass die Methode der Proteinstruktur Muster unterscheidet sich von jedem anderen in der Welt, und das Proteinstrukturmuster ist das Ergebnis des reinen mathematischen Denkens. Diese Methode wird wahrscheinlich eine Rolle spielen und die Entwicklung von Antiviren-Medikamenten oder Impfstoffen beschleunigen. Aber nur Experimente können dies beweisen. "(Bioon.com)

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